IHC/IF Optimizer
Immunostaining protocol optimization.
Use Cases
- - Brain tissue staining
- Liver antigen retrieval
- Antibody dilution optimization
- Fluorescence panel design
Parameters
| Parameter | Type | Default | Required | Description |
|---|
| INLINECODE0 | string | - | Yes | Tissue type (Brain, Liver, Kidney, etc.) |
| INLINECODE1 |
string | - | Yes | Target protein/antigen name |
|
--detection-method | string | IHC | No | Detection method (IHC or IF) |
|
--output,
-o | string | stdout | No | Output file path |
|
--format | string | text | No | Output format (text, json, markdown) |
Returns
- - Recommended retrieval method
- Antibody dilutions
- Blocking conditions
- Counterstain suggestions
Example
Brain tissue + Phospho-protein → Citrate retrieval, 1:200 antibody
Risk Assessment
| Risk Indicator | Assessment | Level |
|---|
| Code Execution | Python/R scripts executed locally | Medium |
| Network Access |
No external API calls | Low |
| File System Access | Read input files, write output files | Medium |
| Instruction Tampering | Standard prompt guidelines | Low |
| Data Exposure | Output files saved to workspace | Low |
Security Checklist
- - [ ] No hardcoded credentials or API keys
- [ ] No unauthorized file system access (../)
- [ ] Output does not expose sensitive information
- [ ] Prompt injection protections in place
- [ ] Input file paths validated (no ../ traversal)
- [ ] Output directory restricted to workspace
- [ ] Script execution in sandboxed environment
- [ ] Error messages sanitized (no stack traces exposed)
- [ ] Dependencies audited
Prerequisites
No additional Python packages required.
Evaluation Criteria
Success Metrics
- - [ ] Successfully executes main functionality
- [ ] Output meets quality standards
- [ ] Handles edge cases gracefully
- [ ] Performance is acceptable
Test Cases
- 1. Basic Functionality: Standard input → Expected output
- Edge Case: Invalid input → Graceful error handling
- Performance: Large dataset → Acceptable processing time
Lifecycle Status
- - Current Stage: Draft
- Next Review Date: 2026-03-06
- Known Issues: None
- Planned Improvements:
- Performance optimization
- Additional feature support
IHC/IF优化器
免疫染色方案优化。
使用场景
- - 脑组织染色
- 肝脏抗原修复
- 抗体稀释优化
- 荧光面板设计
参数
| 参数 | 类型 | 默认值 | 必填 | 描述 |
|---|
| --tissue-type | 字符串 | - | 是 | 组织类型（脑、肝、肾等） |
| --antigen |
字符串 | - | 是 | 目标蛋白/抗原名称 |
| --detection-method | 字符串 | IHC | 否 | 检测方法（IHC或IF） |
| --output, -o | 字符串 | stdout | 否 | 输出文件路径 |
| --format | 字符串 | text | 否 | 输出格式（text、json、markdown） |
返回值
示例
脑组织 + 磷酸化蛋白 → 柠檬酸盐修复，1:200抗体
风险评估
| 风险指标 | 评估 | 等级 |
|---|
| 代码执行 | 本地执行Python/R脚本 | 中 |
| 网络访问 |
无外部API调用 | 低 |
| 文件系统访问 | 读取输入文件，写入输出文件 | 中 |
| 指令篡改 | 标准提示词指南 | 低 |
| 数据泄露 | 输出文件保存到工作区 | 低 |
安全检查清单
- - [ ] 无硬编码凭据或API密钥
- [ ] 无未经授权的文件系统访问（../）
- [ ] 输出不泄露敏感信息
- [ ] 已实施提示注入防护
- [ ] 输入文件路径已验证（无../遍历）
- [ ] 输出目录限制在工作区内
- [ ] 在沙盒环境中执行脚本
- [ ] 错误消息已清理（不暴露堆栈跟踪）
- [ ] 依赖项已审计
前置条件
无需额外Python包。
评估标准
成功指标
- - [ ] 成功执行主要功能
- [ ] 输出符合质量标准
- [ ] 优雅处理边缘情况
- [ ] 性能可接受
测试用例
- 1. 基本功能：标准输入 → 预期输出
- 边缘情况：无效输入 → 优雅错误处理
- 性能：大数据集 → 可接受的处理时间
生命周期状态
- - 当前阶段：草案
- 下次审核日期：2026-03-06
- 已知问题：无
- 计划改进：
- 性能优化
- 增加更多功能支持
